Výzkumný program Biomarkery - identifikace a validace

Vedoucí výzkumného programu:

prof. MUDr. Zdeněk Kolář, CSc.
doc. Mgr. Jiří Drábek, PhD.

Tento program bude převážně zaměřen na identifikaci, verifikaci a zavádění nových biomarkerů pro diagnostické, prognostické a prediktivní účely. Biomarkery mohou být využity jak v primární péči o pacienty, tak ve vývoji léčiv a výzkumu. Cílem tohoto programu je posílit naše znalosti v identifikaci a validaci biomarkerů na molekulární úrovni (genom, transkriptom, proteom a metabolom). Výzkumní pracovníci zapojení do tohoto programu budou schopni provádět komplexní genomické a proteomické analýzy, komplexní analýzy biomolekul modulujících signální a regulační dráhy ve zdravých a nádorových buňkách. Výzkumný program bude generovat významné portfolio informací týkajících se nových biomarkerů a dále bude validovat jejich medicínský význam v různých klinických situacích. Pro identifikační studie bude použito velkých souborů geneticky a funkčně charakterizovaných zdravých a nádorových buněčných linií, primárních nádorů a nenádorových tkání lidského a zvířecího původu, které jsou deponovány v jednotlivých laboratořích BIOMEDREGu. Vybrané validované biomarkery budou dále vyvíjeny jako diagnostické kity nebo přímo licencovány průmyslovým partnerům.

Výsledky: 1. Dobře charakterizovat modelové buněčné linie a sbírky (biobanky) primárních nádorů / tkání; 2. Nové metody pro identifikaci a validaci biomarkerů (siRNA knock-downy, ex vivo a in vivo testy) u nádorových a infekčních chorob; 3. Biomarkery, diagnostické postupy / kity na bázi definovaných a ověřených biomarkerů pro diagnostiku, prognózování a predikci lidských onemocnění. Výsledky budou zveřejněny ve formě odborných prací, výzkumných zpráv, patentů a prezentací na konferencích.

Klíčové metodologické přístupy: Klíčové metodické přístupy: genomika, proteomika, metabolomika, genomový skríning, in vivo validační studie na zvířatech.