Výzkumný program Chemická biologie a experimentální terapeutika

Vedoucí výzkumného programu:

doc. MUDr. Marián Hajdúch, PhD.
MUDr. Petr Džubák, PhD.

Program zajistí vysoce kapacitní testování za pomocí různorodých metod a detekčních platforem (např. vliv na enzymy/proteázy, s G-proteinem spřažené receptory, kinázy, cytotoxicitu, antivirové, antibakteriální, antimykotické, meziproteinové interakce, hodnocení chybného skládání a degradace proteinů, transkripce/exprese a další). Program bude zahrnovat všechna stádia testování – vývoj testů, modifikace, validace, optimalizace chemických struktur, účinných a selektivních molekul identifikovaných pomocí vysoce-kapacitního testování a interaktivní chemie k optimalizaci vývoje léčiv. Bude zajištěna kapacita pro adaptaci/implementaci jednotlivých testů a softwarového vyhodnocení tak, aby mohly být testy zařazeny do programu a pak modifikovány pro vysoce kapacitní testování, a to jak pro projektem generované deriváty, tak i pro komerční chemické knihovny. Vybrané účinné deriváty identifikované screeningem budou seřazeny dle priorit k dalšímu testování a potvrzení účinnosti. Dle srovnání s jinými akademickými centry očekáváme rozšířené testování u maximálně 0,3% z celkového počtu testovaných molekul. Kontrola kvality, primární a konfirmující data budou analyzovány týmem informatiků a ukládány do programové databáze BIOMEDREGu. Za účelem optimalizace informací o aktivních látkách, budou sekce odpovídající za přípravu testů, informatiku a chemickou syntézu pracovat společně v navazujících kolech testování, s cílem zlepšit účinnost a selektivitu původních účinných molekul.

Výsledky: 1. Screeningové metody: Validované HTS screeningové protokoly pro jednotlivé biologické aktivity, 2. Výběr aktivních molekul: Seznam vybraných hitů ze základního testování za použití statistických kritérií, 3. Validované hity budou resyntetizovány nebo zakoupeny a přetestovány, 4. Výběr kandidátů pro klinická léčiva. Výsledky budou zveřejněny ve formě odborných publikací, výzkumných zpráv, patentů a sdělení na konferencích.

Klíčové metodologické přístupy: Klíčové metodické přístupy: vysokokapacitní skríning biologických aktivit látek, genomika, proteomika, metabolomika, bioanalytika, in vivo analýza biologického účinku látek.