Přejít k hlavnímu obsahu

Molekulární a personalizovaná medicína

Laboratoř experimentální medicíny
Seniorská výzkumná skupina

Skupina Dr. Hajdúcha patří k průkopníkům personalizované medicíny v České republice. Zaměřujeme se na molekulární podstatu lidských onemocnění, zejména nádorových. Zabýváme se identifikací a popisem metabolických a signálních drah a genetických a epigenetických změn, které vedou ke vzniku nádorů u člověka. To zahrnuje nádory různého původu a mechanismy karcinogeneze, včetně syndromů dědičné predispozice k nádorům a infekčních či zánětlivých onemocnění. Náš výzkum přináší nové terapeuticky využitelné molekulární cíle a biomarkery pro diagnostiku a cílenou léčbu lidských onemocnění.

V oblasti výzkumu a vývoje léčiv se skupina zaměřuje především na protinádorová léčiva, konkrétně na malé molekuly včetně přírodních látek. Testujeme biologickou aktivitu syntetizovaných chemických sloučenin a u biologicky aktivních látek identifikujeme mechanismy účinku metodami buněčné biologie, biochemie, chemické proteomiky a genetiky. V případě známých molekulárních cílů provádíme vysokokapacitní screening a vyhledáváme farmakologické inhibitory nebo aktivátory biologické aktivity daného molekulárního cíle či buněčného fenotypu. Ve spolupráci s medicinálními chemiky dále optimalizujeme chemické struktury s cílem zvýšit účinnost a zlepšit farmakologické vlastnosti kandidátních molekul. Slibné sloučeniny postupují do preklinického testování a některé z nich i do klinických studií typu proof-of-concept s prvním podáním člověku nebo do klinických studií repozicování léčiv. 

V oblasti biomarkerů se zaměřujeme především na jejich identifikaci, validaci a zavedení pro diagnostické, prognostické a prediktivní účely ve výzkumu nádorových onemocnění i v rutinní klinické praxi. Tyto biomarkery lze využít v situacích přímo souvisejících s péčí o pacienty, vývojem léčiv a výzkumem. Za tímto účelem využíváme své odborné znalosti a zkušenosti s identifikací a validací biomarkerů na multiomické úrovni prostřednictvím komplexního profilování a analýzy genomu, transkriptomu, proteomu a metabolomu. Provádíme komplexní genomické, metabolomické a proteomické analýzy s cílem nalézt změny signálních a regulačních drah ve zdravých buňkách ve srovnání s nádorovými. Vybrané validované biomarkery jsou následně vyvíjeny jako diagnostické soupravy nebo přímo licencovány průmyslovým partnerům.

Oblasti výzkumu
  1. Identifikace nových cílů protinádorových léčiv studiem molekulárních procesů u nádorových, infekčních a vzácných onemocnění.
  2. Výzkum a vývoj kandidátních protinádorových léčiv.
  3. Výzkum a vývoj diagnostických, prognostických a prediktivních nádorových biomarkerů, zejména s využitím neinvazivních technik odběru vzorků.
  4. Hledání nových translačních modelů lidských nádorů in vitro a in vivo (nádorové sféroidy, organoidy, xenografty nádorů odvozené od pacientů).
  5. Využití a komplexní zpracování biomedicínských dat, vývoj nástrojů pro správu dat (data stewardship) a zavádění metod umělé inteligence do analýzy dat.
Časopisy
Basic Methods of Cell Cycle Analysis. International Journal of Molecular Sciences. 2023, 24(12), 3674, ISSN: 1422-0067, PMID: 36835083,  PDF.
NOVÁKOVÁ (ČARNÁ), M., I. ONYANGO, S. KATINA, D. HOLUB, J. NOVOTNÝ, M. NEZVEDOVA, D. JHA, Z. NEDELSKA, V. LACOVICH, T. VYVERE, R. HOUBRECHTS, K. GARCIA-MANSFIELD, R. SHARMA, V. DAVID-DIRGO, M. VYHNALEK, K. TEXLOVA, H. CHAVES, N. BAKKAR, L. PERTIERRA, M. VINKLER, H. MARKOVA, J. LACZO, K. SHEARDOVA, M. HORTOVA-KOHOUTKOVA, J. FRIC, G. FORTE, P. KANOVSKY, S. BELASKOVA, J. DAMBORSKY, J. HORT, N. SEYFRIED, R. BOWSER, G. SEVLEVER, R. RISSMAN, R. SMITH, M. HAJDÚCH, P. PIRROTTE, Z. SPACIL, E. DAMMER, C. LIMBACK-STOKIN, G. STOKIN
Pathogenesis of Alzheimer's disease: Involvement of the choroid plexus. Alzheimer's & Dementia : the Journal of the Alzheimer's Association. 2023, ISSN: 1552-5260, PMID: 36825691,  PDF.
NOVÁKOVÁ (ČARNÁ), M., I. ONYANGO, S. KATINA, D. HOLUB, J. NOVOTNÝ, M. NEZVEDOVA, D. JHA, Z. NEDELSKA, V. LACOVICH, T. VYVERE, R. HOUBRECHTS, K. GARCIA-MANSFIELD, R. SHARMA, V. DAVID-DIRGO, M. VYHNALEK, K. TEXLOVA, H. CHAVES, N. BAKKAR, L. PERTIERRA, M. VINKLER, H. MARKOVA, J. LACZO, K. SHEARDOVA, M. HORTOVA-KOHOUTKOVA, J. FRIC, G. FORTE, P. KANOVSKY, S. BELASKOVA, J. DAMBORSKY, J. HORT, N. SEYFRIED, R. BOWSER, G. SEVLEVER, R. RISSMAN, R. SMITH, M. HAJDÚCH, P. PIRROTTE, Z. SPACIL, E. DAMMER, C. LIMBACK-STOKIN, G. STOKIN
Pathogenesis of Alzheimer's disease: Involvement of the choroid plexus. Alzheimer's & Dementia : the Journal of the Alzheimer's Association. 2023, ISSN: 1552-5260, PMID: 36825691,  PDF.
Volná místa
15 Molecular and Translational Medicine
Projekt: Systems approaches to understanding aging and neurodegeneration
Vedoucí: Das Viswanath M.Sc., Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Role of axonal transport and pathology in neurodegeneration
Vedoucí: Das Viswanath M.Sc., Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Research and development of agents for cancer, neurodegenerative and infectious diseases
Vedoucí: De Sanctis Juan Bautista Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Urban Milan Ph.D., Das Viswanath M.Sc., Ph.D.
K dispozici: 5
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Research and development of agents for cancer, neurodegenerative and infectious diseases
Vedoucí: De Sanctis Juan Bautista Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Urban Milan Ph.D., Das Viswanath M.Sc., Ph.D.
K dispozici: 5
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Isolation and analysis of membrane lipid rafts using a non-targeted metabolomics and lipidomics approach
Vedoucí: Najdekr Lukáš Ph.D.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Use of open-source software approaches for analysis of metabolomic and lipidomic clinical data
Vedoucí: Najdekr Lukáš Ph.D.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Use of open-source software approaches for analysis of metabolomic and lipidomic clinical data
Vedoucí: Najdekr Lukáš Ph.D.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Identification of proteomic biomarkers in proximal fluids and tissues
Vedoucí: Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Preclinical development of molecular imaging agents
Vedoucí: Petřík Miloš Assoc. Prof., PharmDr., Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Ligand- and structure-based modeling of biologically active compounds
Vedoucí: Polishchuk Pavlo Ph.D., M.Sc.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Biologically active molecules and their therapeutic combinations
Vedoucí: Hajdúch Marián M.D., Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Anticancer drugs targeting nucleic acid metabolism
Vedoucí: Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Identification of proteomic biomarkers in exhaled breath condensate patients with systemic or pulmonary disease
Vedoucí: Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Development of 3D pharmacophore signatures and their application in anticancer drug design
Vedoucí: Polishchuk Pavlo Ph.D., M.Sc.
K dispozici: 1
Určeno pro: Doctoral training
Projekt: Genetic and epigenetic biomarkers in health and disease
Vedoucí: Slavkovský Rastislav Ph.D., Džubák Petr M.D., Ph.D., Hajdúch Marián M.D., Ph.D., Drábek Jiří Ph.D., Koudeláková Vladimíra Ph.D.
K dispozici: 5
Určeno pro: Doctoral training
2 Molekulární a translační medicína
Projekt: Plasmonic nanomaterials in cancer theranostics
Vedoucí: Ranc Václav Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doktorské studium
Souhrn: 2 místa v prezenční nebo kombinované formě studia
Projekt: Plasmonic nanomaterials in cancer theranostics
Vedoucí: Ranc Václav Ph.D.
K dispozici: 2
Určeno pro: Doktorské studium
Souhrn: 2 místa v prezenční nebo kombinované formě studia